Дата постройки последнего здания: ок. 2003-2004   см. фотографии объектов той же эпохи

Небольшая кирпичная церковь эклектичной архитектуры, стоящая в восточной части монастыря. В 1720 при архим. Евфимии здесь была построена надвратная Алексеевская церковь в стиле московского барокко, увенчанная тремя убывающими восьмериками. Под церковью с 1820-х помещалась трапезная, наверху в 1829 был устроен придел Виленской Богоматери. В кон. 1920-х здание сломано. Современный кубический одноапсидный храм с богатым декором и шатровым завершением построен в 2000-х. Освящён в 2004, используется как крестильный.

10 сент. 1918, после захвата Казани большевиками, в трапезной Алексеевской церкви были расстреляны десять иноков монастыря во главе с архим. Сергием (Зайцевым), ныне канонизированные.