Дата постройки последнего здания: 1-я пол. XVI в.   см. фотографии объектов той же эпохи

Церковь размещается в первом ярусе монастырской звонницы, стоящей к с юго-востоку от церкви Ярославских Чудотворцев. Первоначально двухшатровая, звонница надстроена в 1809, венчающая ротонда поставлена в 1824. Первоначально Происхожденская (Спасская), церковь была упразднена в кон. XVIII в., восстановлена в 1825, переосвящена в Печерскую в 1860 в честь чудотворной иконы, написанной на стене здания. С юга к церкви были пристроены приделы Нила Столобенского (1877) и Святых Праотцев (1896). В 1918 повреждена обстрелом, в 1920-х разобраны поздние приделы. В настоящее время принадлежит музею.