Основан ростовским князем Константином Всеволодовичем, в XIV-XV вв. княжеская усыпальница. Самый крупный и известный из городских монастырей, в кон. XVII в. третий в стране по численности крепостных. Управлявшие монастырем архимандриты играли важную роль в церковной жизни страны. В 1788 закрыт, постройки заняты ярославским архиерейским домом. Сохранились Святые ворота (1516) с часозвонней над ними, стены и башни (XVII-XIX вв.), келейные корпуса (XVII-XIX вв.). В 1918 сильно поврежден в ходе боев, закрыт. Был занят под жилье, затем использовался военкоматом, сельскохозяйственной школой. С 1950-х реставрировался, в 1959 полностью передан ярославскому музею. В настоящее время в монастыре размещены основные помещения ярославского музея-заповедника.

Дата постройки последнего здания: 1825-1833   см. фотографии объектов той же эпохи

Кирпичный храм, примыкающий с юга к Преображенскому собору. Кирпичная Входоиерусалимская церковь XIII в. была заменена новой, также Входоиерусалимской, в 1617-1619. Ныне существующая крупная однокупольная церковь в стиле позднего классицизма выстроена попечением архиепископа Авраамия в 1825-1833 на фундаментах здания 1610-х. В 1918 повреждена в ходе боев, затем отремонтирована, богослужения прекращены в кон. 1920-х. В настоящее время принадлежит музею.

В церкви с XVII в. до 1919 хранились мощи князей Федора, Давида и Константина Ярославских (обретены в 1463).

Дата постройки последнего здания: 1-я пол. XVI в.   см. фотографии объектов той же эпохи

Церковь размещается в первом ярусе монастырской звонницы, стоящей к с юго-востоку от церкви Ярославских Чудотворцев. Первоначально двухшатровая, звонница надстроена в 1809, венчающая ротонда поставлена в 1824. Первоначально Происхожденская (Спасская), церковь была упразднена в кон. XVIII в., восстановлена в 1825, переосвящена в Печерскую в 1860 в честь чудотворной иконы, написанной на стене здания. С юга к церкви были пристроены приделы Нила Столобенского (1877) и Святых Праотцев (1896). В 1918 повреждена обстрелом, в 1920-х разобраны поздние приделы. В настоящее время принадлежит музею.