Дата постройки последнего здания: 1745-1770   см. фотографии объектов той же эпохи

К югу от собора стоит двухэтажный Феодоровский корпус, который в 1725 начал строить Т. Швертфегер, в 1742 продолжил П. А. Трезини, а после его отъезда завершил И. Росси. Юго-восточный угол корпуса завершает заложенная 9 авг. 1745 и вчерне оконченная через 7 лет двухэтажная церковь. Отделка верхнего и нижнего храмов закончилась к 1766, но освящение задержалось до 1770, когда верхний был наречён во имя благ. кн. Феодора Ярославича, брата св. Александра Невского, а нижний - во имя свт. Иоанна Златоуста. После переделки в 1840-1842 храмы были переосвящены: верхний во имя Николая Чудотворца, а нижний - во имя благ. кн. Феодора. В 1889 с алтарной стороны по проекту Г. И. Карпова начата постройка усыпальницы митр. Исидора, где 6 окт. 1891 освящена в качестве придельной церковь прп. Исидора Пелусиота. С окт. 1930 Феодоровская церковь не действовала, но окончательно закрыта постановлением Президиума Ленсовета от 2 сент. 1931, а Исидоровская - тремя месяцами позднее. В настоящее время храм реставрируется, нижний престол вновь сделан Златоустовским.

С 1806 до нач. XX в. в нижнем храме производились захоронения. Именно здесь были погребены грузинские и имеретинские царевичи, умершие в Петербурге, а также гр. С. Г. Строганов. Ни одно из захоронений (их было около 100) не сохранилось. За четверть века существования придельной церкви прп. Исидора Пелусиота в ней было произведено свыше 150 захоронений, прежде всего архиереев и духовных лиц. Кроме того, здесь покоились: видный деятель русской культуры Т. И. Филиппов, математик И. А. Вышеградский, писатель кн. В. П. Мещерский. После закрытия храма прах митрополитов Исидора и Палладия перенесли на Никольское кладбище, остальные захоронения уничтожили.