Первые насельники появились в Подгорах в 2003, в 2004 сюда переведена монашенская мужская община из самарской церкви Сергия Радонежского и Троицы Живоначальной, которая теперь является подворьем монастыря. В 2007 Св. Синодом община утверждена как Заволжский мужской монастырь Честного и Животворящего Креста Господня.

Рядом с монастырём у подножия горы Манчиха находится местночтимый источник Илии Пророка, известный несколько столетий. Источник восстановлен в начале 2000-х, обустроен срубом колодца и купальней, освящен 8 авг. 2004.