Дата постройки последнего здания: 1559-1585   см. фотографии объектов той же эпохи

Главный монастырский собор, стоит по центру территории лавры. Строился с 1559 на вклад царя Ивана Грозного, окончен в 1585 при царе Федоре Иоанновиче. Большой кирпичный пятикупольный шестистолпный храм, воспроизводящий объемную композицию Успенского собора московского Кремля. В алтарной части устроены приделы Феодора Стратилата, мученицы Ирины и Николая Чудотворца (устроен в 1609). В крипте под собором, при усыпальнице московских митрополитов, в 1898 на средства Е. С. Ляминой устроен придел Всех Святых, в 1920-х упраздненный, а в 1981 восстановленный как храм Всех Святых, в земле Российской Просиявших, с приделами Иннокентия Московского и Собора Радонежских Святых. В главном храме уцелели росписи 1684. Богослужения в соборе прекращены в 1920, возобновлены в 1946.

В соборе хранятся мощи св. Иннокентия, митр. Московского (+1879) и прп. Максима Грека (+1556). У западной паперти собора в палатке погребен царь Борис Годунов с семьей. Крипта под собором в кон. XIX - 2-й пол. ХХ вв. служила местом захоронения митрополитов, а позже патриархов Московских.

Дата постройки последнего здания: 1476   см. фотографии объектов той же эпохи

Каменный четырехстолпный трехапсидный одноглавый храм, построенный в 1476. Здание имеет уникальную объемную композицию - в нижней части барабана устроена звонница. В нач. XVII в. к церкви пристроена шатровая колокольня, разобранная в сер. XVIII в., позже здание обстроено папертями. С севера была пристроена часовня над гробом прп. Максима Грека, расширенная в 1847. С юга в 1867 пристроен придел Филарета Милостивого, в котором был похоронен митр. Московский Филарет. Богослужения прекращены в 1920, в кон. 1940-х церковь возвращена верующим. В сер. ХХ в. церковь отреставрирована, поздние пристройки разобраны в 1938-1940.

В настоящее время в церкви хранятся мощи Антония Радонежского (+1877, наместник лавры в 1831-1877).

Дата постройки последнего здания: 1745-1753   см. фотографии объектов той же эпохи

Небольшой каменный однокупольный ротондальный храм в стиле барокко. Построен в 1745-1753 на средства графа А. Г. Разумовского на месте разобранной поварни (3-я четв. XV в.). В церкви был помещен снятый со стены поварни чудотворный образ Богоматери Смоленской, высеченный на камне. Западная паперть, пристроенная в 1854, разобрана при реставрации в сер. ХХ в. Возвращена верующим в кон. 1940-х, для регулярных богослужений не используется.

Дата постройки последнего здания: 1893-1896   см. фотографии объектов той же эпохи

Храм при новой монастырской больнице, построенной в 1893-1896 к западу от стен лавры, в Пафнутьевом саду, и связанной с лаврой переходом. Одноглавая двухэтажная церковь в псевдорусском стиле, помещенная в центральной части больничного корпуса. В нижнем этаже в 1901 устроен храм св. вмч. Варвары, Анастасии и Акилины. В 1920-х здание занято больницей. Возвращено верующим в 1988, в настоящее время корпус передан Московской духовной семинарии, храм служит домовым при семинарии.