Дата постройки последнего здания: 1745-1770   см. фотографии объектов той же эпохи

К югу от собора стоит двухэтажный Феодоровский корпус, который в 1725 начал строить Т. Швертфегер, в 1742 продолжил П. А. Трезини, а после его отъезда завершил И. Росси. Юго-восточный угол корпуса завершает заложенная 9 авг. 1745 и вчерне оконченная через 7 лет двухэтажная церковь. Отделка верхнего и нижнего храмов закончилась к 1766, но освящение задержалось до 1770, когда верхний был наречён во имя благ. кн. Феодора Ярославича, брата св. Александра Невского, а нижний - во имя свт. Иоанна Златоуста. После переделки в 1840-1842 храмы были переосвящены: верхний во имя Николая Чудотворца, а нижний - во имя благ. кн. Феодора. В 1889 с алтарной стороны по проекту Г. И. Карпова начата постройка усыпальницы митр. Исидора, где 6 окт. 1891 освящена в качестве придельной церковь прп. Исидора Пелусиота. С окт. 1930 Феодоровская церковь не действовала, но окончательно закрыта постановлением Президиума Ленсовета от 2 сент. 1931, а Исидоровская - тремя месяцами позднее. В настоящее время храм реставрируется, нижний престол вновь сделан Златоустовским.

С 1806 до нач. XX в. в нижнем храме производились захоронения. Именно здесь были погребены грузинские и имеретинские царевичи, умершие в Петербурге, а также гр. С. Г. Строганов. Ни одно из захоронений (их было около 100) не сохранилось. За четверть века существования придельной церкви прп. Исидора Пелусиота в ней было произведено свыше 150 захоронений, прежде всего архиереев и духовных лиц. Кроме того, здесь покоились: видный деятель русской культуры Т. И. Филиппов, математик И. А. Вышеградский, писатель кн. В. П. Мещерский. После закрытия храма прах митрополитов Исидора и Палладия перенесли на Никольское кладбище, остальные захоронения уничтожили.

Дата постройки последнего здания: 1717-1723   см. фотографии объектов той же эпохи

Высокая башня двухэтажного храма выстроена в 1717-1723. Верхняя четырёхстолпная Александро-Невская церковь освящена 30 авг. 1724. Лепные работы в ней выполнили Иван и Игнатий Росси, плафонную роспись - И. Н. Никитин и И. Я. Вишняков, образа написал Г. Гзель. Нижняя Благовещенская церковь освящена 25 марта 1725. Образа в "каменном" (алебастровом) иконостасе написали И. Г. Адольский, И. Н. Никитин и Д. Н. Соловьев. Резные работы делали резчики Адмиралтейства. Массивные композитные колонны поддерживали плоское перекрытие с плафоном "Имя Божие" кисти Адольского и М. Л. Негрубова. При ремонтных работах в период 1838-1841 иконостасы были заменены. Храм закрыт в 1933, при этом нижнюю церковь передали "Музею-некрополю", а верхнюю в 1935 разделили межэтажными перекрытиями. С 1948-1949, после капитального ремонта, оба этажа здания заняты экспозицией Музея городской скульптуры. Комплексная реставрация проведена в 1988-1999. 30 авг.2023 ключи от храма переданы лавре, церковь стала действующей.

В верхнем храме до переноса в 1790 в Троицкий собор покоились мощи благ. кн. Александра Невского. Под нижней церковью расположена усыпальница, где среди прочих были погребены: царица Прасковья Феодоровна, малолетние дочери Александра I, архиеп. Сильвестр (Кулябка), канцлер А. А. Безбородко, дипломат Н. И. Панин, полководец А. В. Суворов, президент Академии художеств И. И. Бецкой, генерал-фельдмаршал А. Г. Разумовский, обер-камергер И. И. Шувалов, основатель Московского университета (сохранилось около 50 захоронений).