Дата постройки последнего здания: 1909   см. фотографии объектов той же эпохи

Первое известное упоминание о храме при женском Мариинском училище относится к 1872. 14 декабря 1902 училище было преобразовано в институт с семилетним курсом обучения, в связи с чем было решено построить более вместительное здание – вместе с учебным заведением в него был перемещён домовый Екатерининский храм. Второй Екатерининский храм освящён 24 октября 1909, обустроен на средства Кубанского казачьего войска. Размещался на втором этаже новопостроенного (по проекту А. П. Косякина) здания института. Закрыт с установлением советской власти.

21 ноября 1914 во время своего пребывания в городе перед отъездом на Кавказский фронт Екатерининский храм посетил русский император Николай II.