Знаете - пока что сам не соображу
Мне картина казалась такой. Зарегистрировали общину, первое время служили, где место нашлось, а между тем оформили землеотвод и в конечном итоге на нём соорудили большую церковь. Но церковь на Фрунзе на здание "где место нашлось" похожа мало. Это вполне себе церковь, и крупная.
Вариантов, по большому счёту, два.
Либо от участка на Вокзальной на самом-то деле или отказались, или решили не использовать его под строительство основных зданий, а решили строиться на Фрунзе. Ну а что крест на Вокзальной стоит и во всех справочниках она посчитана - так то оттого, что есть определенная инерция бюрократическая. В таком случае надо будет поправить для Пантелеймоновского храма адрес - ну а фотографию с закладным крестом на Вокзальной сохранить для истории.
Либо - постройка на Фрунзе - всё же временная, а от строительства большого храмового комплекса на Вокзальной не отказались, а просто ещё не начали. Тогда надо добавить в каталог запись под ту церковь, что стоит на Фрунзе, оставив для "настоящей Пантелеймоновской" статус "намечена к постройке".
Есть, конечно, ещё вариант - что "церковь святого Михаила" - это вообще какая-то отдельная постройка, например, со статусом Патриаршего подворья. Но тут мне это кажется маловероятным.
Разбираться надо.
Но боюсь, разобраться только на месте можно, что тут именно произошло. Если сможете уточнить - замечательно будет.